非细胞体系的 DNA 甲基化测序
细胞中游离 DNA 的甲基化研究
亚硫酸氢盐转化DNA文库的制备和下一代测序技术的进步,使得能够从血浆或血清样本中存在的少量输入DNA中测量甲基化水平。具体的 基因组 可以使用亚硫酸氢盐测序通过选择特定的 DNA 序列来监测感兴趣的区域,例如 CpG 岛。研究人员可以使用甲基化测序来了解构成复杂疾病的机制。
方达 已开发并验证了通过测序进行靶向和全局甲基化分析的协议,并优化了从液体活检样本中分离 cfDNA 以最大限度地减少该服务的样本输入要求。
- 体液分析
- 测序
- 生物标志物发现
- 伴随诊断
- 预测建模
适用于 cfDNA 亚硫酸氢盐测序的样品类型
样本类型包括全血、血清和血浆。 方达提供基于血液的生物流体样本的 cfDNA 分离服务。我们是生物安全 2 级 (BSL-2) 实验室,可以接受含有与人类疾病相关的试剂的样本。
样品类型 | 最低输入要求 | 样品提交清单 |
---|---|---|
游离DNA | 10 ng | cfDNA |
体液 | 4 ml | 体液 |
gDNA 读取摘要
- 用基因组坐标、每个样本的计数和注释检测序列读数。
标准 cfDNA 亚硫酸氢盐测序报告
- 识别甲基化位点,显示每个位点的甲基化调用和甲基化百分比。
- 统计分析结果显示,甲基化位点在组间的甲基化水平、最近基因的注释以及甲基化位点与基因的相对位置上存在显著差异。
- 富含CpG的基因组区域的图谱,表明差异甲基化区域在染色体上的分布。
- CpG 覆盖率和 CpG 甲基化水平的分布直方图。
额外的原始数据
- 压缩的 FASTQ 文件
- 映射到基因组的原始独特序列(FASTA 格式)
- 原始和标准化读取计数,以及读取映射到每个查询的每个数据库的每个 gDNA
方达致力于提供严格的科学专业知识,以确保最高质量和合规性。我们的 药物发现 实验室服务团队拥有在药物开发各个阶段与您合作的专业知识。